Q: お相手の譲渡証明書と押印した印鑑の印鑑証明書も同じ書類ですか

はい、同じ譲渡証明書の譲受人欄で大丈夫です。そちらに記載してもらってから印鑑を押印してもらいましょう。押印し終わったら、同じように譲受人管轄の区役所など役場へ行って押印した印鑑の印鑑証明書をもらって来てもらいましょう。